保护柱的选择和使用指南如下：
1. 根据分析柱的填料品牌选择保护柱，要与分析柱保持一致，以保证选择性一致。
2. 根据分析柱的规格选择匹配的保护柱，填料粒径与分析柱的粒径相近，保护柱的内径与分析柱的内径相近。
3. 对于精细分离，保护柱本身的装填柱效要足够好，以降低峰扩散，提高分离度。
4. 对于精细分离或者小内径色谱柱分离，保护柱的连接死体积要尽可能小。
5. 如果是用于UHPLC柱，还要考虑保护柱的耐压能力。
在使用保护柱的过程中，需注意以下几点：
1. 专柱专用，避免保护柱成为不同项目的交叉污染源。
2. 当峰的理论塔板数下降15%，或是柱压上升15%，或是关键分离度下降15%时，应及时更换保护柱。
3. 不慎发生强污染时，可以将分析柱卸下，单独冲洗保护柱，可以使污染物更快的从保护柱中流出。但不可以超声保护柱。
4. 在连接保护柱时，要尽可能缩短连接管路，减少死体积，降低柱外展宽效应。
5. 如同一保护柱配不同的分析柱使用，每次使用前，保护柱需先清洗并用流动相平衡保护柱一段时间后，再接分析柱使用。
